核酸電泳相關試劑、緩衝液的配製方法
50x TAE Buffer (pH8。5)
組份濃度2M Tris-醋酸,100 mM EDTA
配製量1 L
配製方法
1。 稱量下列試劑,置於1 L燒杯中。
Tris
242 g
Na2EDTA·2H20
37。2 g
2。 向燒杯中加入約800 ml的去離子水,充分攪拌溶解。
3。 加入57。1 ml的醋酸,充分攪拌。
4。 加去離子水將溶夜定容至1 L後,室溫儲存。
10x TBE Buffer (pH8。3)
組份濃度890 mM Tris-硼酸,20 mM EDTA
配製量1 L
配製方法
1。 稱量下列試劑,置於1 L燒杯中。
Tris
108 g
Na2EDTA·2H20
硼酸
7。44 g
55 g
Tris
108 g
Na2EDTA·2H20
硼酸
7。44 g
55 g
Tris
108 g
Na2EDTA·2H20
硼酸
7。44 g
55 g
2。 向燒杯中加入約800 ml的去離子水,充分攪拌溶解。
3。 加去離子水將溶波定容至1 L後,室溫儲存。
10x MOPS Buffer
組份濃度200 mM MOPS。,20 mM NaOAc。,10 mM EDTA
配製量1L
配製方法
1。 稱量41。8 g MOPS, 置於1 L燒杯中。
2。 加約700 ml DEPC處理水,攪拌溶解。
3。 使用2M NaOH調節pH值至7。0。
4。 再向溶液中加入下列試劑。
1M NaOAc (DEPC 處理)
20 ml
0。5 M EDTA (pHB。0) (DEPC處理)
20 ml
5。 用DEPC處理水將溶液定容至1 L。
6。 用0。45 μm濾膜過濾除去雜質。
7。 室溫避光儲存。
注意:溶液見光或高溫滅菌後會變黃。變黃時也可使用,但變黑時不要使用。
溴乙錠(10 mg/ml)
組份濃度10 mg/ml溴乙錠
配製量100 ml
配製方法
1。 稱量1 g溴乙錠,加入到100 ml容器中。
2。 加入去離子水100 ml,充分攪拌數小時完全溶解溴乙錠。
3。 將溶液轉移至棕色瓶中,室溫避光儲存。
4。 溴乙錠的工作濃度為0。5 μg/ml。
注意:溴乙錠是種致癌物質,必須小心操作。
Agarose凝膠
配製方法
1。 配製適量的電泳及制膠用的緩衝液(通常是0。5×TBE或1×TAE。
2。 根據制膠量及凝膠濃度,準確稱量瓊脂糖粉,加入適當的錐形瓶中。
3。 加入一定量的電泳緩衝液(總液體量不宜超過錐形瓶的50%容量)。
注:用於電泳的緩衝液和用於制膠的緩衝液必須統一。
4。 在錐形瓶的瓶口封上保鮮膜,並在膜上扎些小孔,然後在微波爐中加熱熔化瓊脂糖。加熱過程中,當溶液沸騰後,請戴上防熱手套,小心搖動錐形瓶,使瓊脂糖充分均勻熔化。此操作重複數次,直至瓊脂糖完全熔化。必須注意,在微波爐中加熱時間不宜過長,每次當溶液起泡沸騰時停止加熱,否則會引起溶液過熱暴沸,造成瓊脂糖凝膠濃度不準,也會損壞微波爐。熔化瓊脂糖時,必須保證瓊脂糖充分完全熔化,否則,會造成電泳影象模糊不清。
5。 使溶液冷卻至 60℃左右,如需要可在此時加入溴乙錠溶液(終濃度0。5 μg/ml),並充分混勻。
注:溴乙錠是種致癌物質。使用含有溴乙錠的溶液時,請戴好手套。
6。 將瓊脂糖溶液倒入制膠模中,然後在適當位置處播上梳子。凝膠厚度一般在3~5 mm之間。
7。 在室溫下使膠凝固(大約30分鐘~ 1小時),然後放置於電泳槽中進行電泳。
注:凝膠不立即使用時,請用保鮮膜將凝膠包好後在4C下儲存,一般可儲存2~5天。
瓊脂糖凝膠濃度與線形DNA的最佳分辨範圍
瓊脂糖濃度
最佳線形DNA分辨範圍(bp)
0。5%
1。000 ~ 30。000
0。7%
800~ 12。000
1。0%
500 ~ 10。000
1。2%
400 ~ 7。000
1。5%
200 ~ 3。000
2。0%
50 ~ 2。000
6x Loading Buffer (DNA 電泳用)
組份濃度
30 mM
EDTA
36% (V/V)
Glycerol
0。05% (WV)
Xylene Cyanol FF
0。05% (WV)
Bromophenol Blue
配製量500 ml
配製方法
1。 稱量下列試劑,置於500 ml燒杯中。
EDTA
4。4 g
Bromophenol Blue
250 mg
Xylene Cyanol FF
250 mg
2。 向燒杯中加入約200 ml的去離子水後,加熱攪拌充分溶解。
3。 加入180 ml的甘油(Glycerol)後,使用2 M NaOH調節pH值至7。0。
4。 用去離子水定容至500 ml後,室溫儲存。
6x Loading Buffer (RNA電泳用)
組份濃度
10 mM
EDTA
50% (V/V)
Glycerol
0。25% (WV)
Xylene Cyanol FF
0。25% (WV)
Bromophenol Blue
配製量10 ml
配製方法
1。 稱量下列試劑,置於500 ml燒杯中。
0。5 M EDTA (pH
8。0)
200 ul
Bromophenol Blue
25 mg
Xylene Cyanol FF
25 mg
0。5 M EDTA (pH
8。0)
200 ul
Bromophenol Blue
25 mg
Xylene Cyanol FF
25 mg
2。 向燒杯中加入約4 ml的DPEC處理水後,加熱攪拌充分溶解。
3。 加入5 ml的甘油(Glycerol)後,充分混勻。
4。 用DPEC處理水定容至10 ml後,室溫儲存。
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