生物資訊軟體安裝3：安裝預編譯版本的BLAST

由於我國特殊的網路環境，有時候我們透過conda無法順利下載和安裝生信軟體，我們必須還得熟悉傳統的軟體安裝方式，以備不時之需。

傳統的軟體安裝方式包括：安裝預編譯版本的軟體和從原始碼安裝軟體。由於從原始碼安裝軟體的編譯過程非常緩慢，一般情況下優先安裝預編譯版本。

1.從ftp下載預編譯版本的BLAST安裝包

# 選擇Linux系統安裝包，複製連結地址，wget下載

# 也可使用瀏覽器下載後，透過FileZilla上傳到伺服器

wget ftp：//ftp。ncbi。nlm。nih。gov/blast/executables/LATEST/ncbi-blast-2。7。1+-x64-linux。tar。gz`

2.解壓縮軟體

tar -zxvf ncbi-blast-2。7。1+-x64-linux。tar。gz

解壓縮後，在安裝目錄下的

bin

資料夾下課看到可執行檔案：

透過命令

。/blastp -help

可以返回blastp的幫助文件，說明BLAST程式可成功執行：

3.把程式的可執行檔案新增到環境變數中

我們手動安裝的預編譯版本的軟體，預設情況下是不會把可執行檔案新增到系統的環境變數中去的，每次我們執行程式時，都需要使用程式的絕對路徑，這樣就非常麻煩。我們可以手動新增到環境變數中：

# cd 進入home目錄中

cd ~

# 開啟。profile檔案

vim 。profile

# 在。profile中加入新增環境變數的命令，其中export PATH=$PATH：後面是blast可執行檔案的絕對路徑

export PATH=$PATH：/mnt/h/Workspace/Biosoft/ncbi-blast-2。7。1+/bin/

# 使新增的環境變數立即生效

source 。profile

直接執行blastp程式，可以順利執行，安裝成功！