請問蛋白點突變後如何檢視氫鍵數量變化呢？

rpqblh2022-04-04 09:34:09

我覺得要看變化的殘基特性吧，有些關鍵殘基的變化是會明顯改變結構的，有可能需要先弄個結構預測（計算機水平）更有甚者要做晶體衍射確定結構。

知乎使用者2022-04-13 00:38:16

大概看的話：pymol直接點突變 選擇構想最優的 之後再選擇find周圍的氫鍵，再和未突變前的對比一下，應該很容易就看得出來。

細緻一點：要考慮點突變帶來的蛋白整體或者區域性的構象變化；先突變後的蛋白進行結構預測；然後根據新的結構找氫鍵

其他的可以直接找氫鍵數量變化的軟體可能是分子動力學模擬？這個期待後續的答案了。