下載轉錄組測序文獻資料的方法

1。在文章method裡找到RNA-Seq是如何存放的

2。在GEO上查詢GSE81916 GEO站點：

https：//www。

ncbi。nlm。nih。gov/geo/

3。找到檔案地址

for （（i=56；i<=63；i++）） ；

> do wget ftp：//ftp-trace。ncbi。nlm。nih。gov/sra/sra-instant/reads/ByStudy/sra/SRP/SRP075/SRP075747/SRR35899$i/SRR35899$i。sra；

> done

4。等待下載

ls *sra |while read id；

do ~/biosoft/sratoolkit/sratoolkit。2。6。3-centos_linux64/bin/fastq-dump –split-3 $id；

done