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怎麼設計引物

作者:由 王厥 發表于 書法時間:2017-11-07

來一波狗糧!

怎麼來設計

引物

呢?

?今天我終於會了點皮毛,為了記住也方便一些和我一樣的科研?,不廢話,學起來!

就拿我要要設計的基因為例子,PPIB ,

現在NCBI上選擇gene,然後輸入目的基因,直接上圖!

怎麼設計引物

怎麼設計引物

找到這個基因的ID號,然後直接在百度上搜索primerbank這個網站,上圖!

怎麼設計引物

怎麼設計引物

點選進去,

怎麼設計引物

怎麼設計引物

在主頁,我們就可以看到幾個引數,我呢把它改成NCBI gene ID/ human /5479(這為基因的ID號)不過這些完全根據自己的實際情況來選擇。點選sumit。OK,上圖!

怎麼設計引物

怎麼設計引物

這就得到了我們的引物,不過呢,我們還要去驗證下哈,可以在NCBI或者UCSC上面blast一下!lets ?!

現在NCBI上面驗證

怎麼設計引物

怎麼設計引物

點選BLAST

怎麼設計引物

怎麼設計引物

在彈出的頁面上找到

primer-blast

點選進去哈

怎麼設計引物

怎麼設計引物

在primer parameters裡面輸入之前在primerbank 得到的引物的正反鏈,?!

怎麼設計引物

怎麼設計引物

好吧,這個我也不是很懂,那麼,我再用UCSC來驗證一下

怎麼設計引物

怎麼設計引物

百度上搜索UCSC,點選進去主頁

怎麼設計引物

怎麼設計引物

下拉tools點選In-silico PCR

怎麼設計引物

怎麼設計引物

一樣的方法,改好引數輸入正反引物,提交!

怎麼設計引物

怎麼設計引物

點選最上面的連結,別問我為什麼!

怎麼設計引物

怎麼設計引物

哈哈,這個可以看到設計的引物還是比較好的,因為也包括

內含子

了。。。。棒棒噠!

科研狗繼續學習去啦

標簽: 點選  引物  ncbi  id  UCSC