不同物種間可以進行基因交流嗎？
知乎使用者2015-11-11 03:11:54不請自來，權當是我的自嗨，求評論輕噴
首先物種這個概念很難有一個唯一的定義，也並不是能不能產生可育後代這麼簡單的，這是因為研究過程中往往不可能基於能否產生可育後代來分種（通常基於形態、分子上的差異等），所以按照可育後代這個標準分種的話，會有大把的例外= =
以下是不能用這個標準分種的各種理由：
首先是化石種，滅都滅絕了，也不能去判斷到底能不能生孩子了。
動物很多生殖隔離是發生在受精之前的，比如行為和性成熟時間上的差別，這些可能都是有一些彈性的。
植物亦然，傳粉者的差異開花時間上的差異都會導致自然狀態下受精的隔離，然而這並不代表他們沒有產生可育後代的可能。
……
基於上述標準劃分出來的物種發生種間雜交是可以普遍存在的，而且近緣種的雜交在演化歷程之中可能也扮演了相當重要的角色。
以下是例子：（大部分來自wikipedia，主要是答主沒有認真看引文，以後豐富吧）
農作物中間，尤其是糧食作物，種間雜交是十分普遍的，比如小麥
自然狀態下，被子植物大約有2%~4%是有過種間雜交的，這一比例在蕨類植物中可能可以達到7%［1］
動物種間雜交相對少，但也有部分例子［2］
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以下是跟問題本身沒有關係，而且也缺乏事實證據的題外話：
題主問題背景提到的眼點相關的東西：
很遺憾，答主並不是做動物功能基因組的，關於眼點那個現象本身並沒有具體的瞭解，加上這個中文翻譯實在是看不明白……建議把關鍵詞標上英文，檢索文獻的時候會方便一點。
如果按照我的理解（因為真的看不懂，所以可能跟原意差了十萬八千里 = =），題主大概是認為在親緣關係極遠的種中間，眼點這個性狀從功能到內部的遺傳機制都很相似，於是就可能存在基因從一個種傳遞到另一個遠緣種的現象。“跨界”這麼大的距離，這麼多蛋白編碼基因和相關的調控序列，一下子從一個種跑到另一個種裡面，在沒有看到支援性的文獻之前，總我感覺怪怪的 = =
以下是基於經驗的不靠譜猜想：
親緣關係差異很大的不同物種中，很多序列其實都可能是高度同源甚至於保守的，保守的基因很多是與基本的生命活動相關的（比如各種基礎能量代謝相關的基因）。另外，序列的同源性和功能一致性間的對應可能並不密切，同源序列的產物可能功能差異很大，而且同一序列的功能在演化過程中也不是固定的。所以更可能是以下兩種情況：1。這個功能在進化中本身就是同源而且遺傳上保守的2。趨同進化中同源序列的表達產物恰好重新又有了相似的功能。
Reference：
［1］ Otto， S。； Witton， P。J。
Polyploid incidence and evolution
。 Annual Review of Genetics。 2000，
34
： 401–437。
doi
：
10。1146/annurev。genet。34。1。401
。
［2］ Larsen， P。A。； Marchán-Rivadeneira， M。R。； Baker， R。J。
Natural hybridization generates mammalian lineage with species characteristics
。 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America。 5 January 2010，
107
： 11447–11452。
doi
：
10。1073/pnas。1000133107
。
匿名使用者2015-11-11 10:40:09謝邀～～～
推薦幾個詞，題主感興趣可以理解一下： 雜交，基因漸滲，水平基因轉移，新基因。
Price2015-11-19 17:31:36水平基因轉移，你知道你的基因有部分是源自於細菌和病毒的嗎
安逸的北極生物2015-12-10 09:58:41看了一樓的啟發，我感覺應該分類討論。
一，對於高度保守序列是因為唯一選擇，自然選擇淘汰了其他並且日益變異淘汰篩選迴圈到現在
二，對於保守序列，就是篩選後分類的結果就是說，不是唯一選擇而是多個選擇，因為由一系列的相對應的路線（就像不同啟動子被不同的因子識別），所以有了多個選擇的線路，再後來就是多歧分化和孤頻變異。
三，而這個線路的選擇過程則是1樓說的2的結果，比如硒代半胱氨酸的密碼子選擇
回到題主，，，因為我們使用基因的就是為了繁殖生長的調控。
一，不算人，單體生物物種的繁殖資訊時間器官地點等都有分離和組合。
二，構件生物因為自身的侷限性必然出現特別明顯的雜交，但雜交水平隨著進化和適應會減小並且細胞群體的自我意識也越來越強。
三，微生物和病毒，，，，，，就算了吧，，，還要在分類說太麻煩，總的來說就和人類一樣都喜歡在這兒那兒搗鼓搗鼓，個人認為這些基因交流造成了兩個基因爆炸的時代，創造了太多的可能性，至於是福是禍，不敢妄議了，畢竟爆炸之後我們看到的活下來的種類遠遠小於淘汰的種類。
四，所以定義的有比較穩定基因庫的成熟物種是一般拒絕種間基因交流的。
