SnapGene操作指南 | 引物設計ⅠⅠ
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上一篇小SG為大家介紹了引物的一些基本資訊,以及
如何利用SnapGene生成新的引物
。
回顧:
本篇帶大家繼續瞭解生成引物之後還有哪些實用操作吧!
注:SnapGene軟體自帶中文切換,不要再浪費時間找漢化資源啦!
常見問題1:
Step1 檢視引物結合位點
如要顯示引物資訊的概要,將滑鼠放在引物名稱上即可。注意引物結合位點的數量。
或者,雙擊引物開啟Edit Primer對話方塊。如果一個引物有多個結合位點,黃色框中會顯示警告資訊。結合位點的總數也會顯示。你可以使用控制按鈕在不同的引物結合位點之間切換。
Step2 調整雜交引數
如需調整引物雜交引數,請單擊Primers → Hybridization Parameters。彈出的對話方塊提供了調節引物3 ‘端匹配鹼基數以及最低解鏈溫度控制元件。
Step3 調整新檔案的預設雜交引數
常見問題2:
Step1 隱藏引物
若要隱藏所選的可見引物,單擊Primers → Show or Hide Primers → Hide Selected Primer;如果選擇了多個引物,則可以使用Primers → Show or Hide Primers → Hide All Primers to hide all of them。
Step2 顯示引物
要顯示隱藏的引物,切換到引物檢視,然後單擊引物名稱左側的空複選框。所選的引物現在可以在其他檢視中看到;或者,選擇引物名稱,點選Primers → Show or Hide Primers → Show Selected Primer。
Step3 顯示覆數引物
如要顯示隱藏的多條引物,可以在引物檢視中選擇引物,然後點選 Primers→ Show or Hide Primers → Show Selected Primers。
Step4 使用“眼睛”按鈕改變引物是否可見
若要切換引物是否可見,從“眼睛”按鈕旁邊的選單選項中選擇。
Step5 使用側邊工具欄切換引物可見性
在地圖或序列檢視中,點選側邊工具欄中的“Show primers”按鈕, 可切換在引物檢視中選中其複選框的引物的顯示。
常見問題3:
Step1 檢視引物列表
引物檢視中的列標題也是排序按鈕。預設情況下,選擇Binding Sites按鈕,這意味著引物是按位置排序的。
Step2 更改主排序引數
要主要按另一個引數排序,按相應的列按鈕即可。在本示例中,引物現在主要按Tm排序,然後按結合位點排序。
Step3 指定其他的排序引數
要指定二級和三級排序引數,可以按primer檢視最右邊的按鈕來開啟Sort primer列表對話方塊;或者也可以單擊“Primers → Sort Primer List。。。”。
Step4 完全指定排序引數
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