miRNA靶基因驗證
一、樣品準備:
1、質粒轉染細胞
(1)細胞鋪板:將細胞按50%的密度接種到細胞培養12孔板內。
(2)轉染:16h左右細胞約70%時轉染螢光素酶報告基因質粒,每個樣品設定3個復孔。首先設計四組:
空白組(轉染試劑+細胞)
質粒組
質粒+miRNA NC組
質粒+miRNA mimics組
● 配製質粒組:按照每空50ng質粒,同時每孔20ul無血清培養基計算需用量,標記為A。
● 配製miRNA NC/mimics:miRNA NC/mimics的終濃度為20nM,同時每孔20ul無血清培養基計算需用量,分別標記為B、C。
● 配製對應轉染試劑:按照每孔0。5μL轉染試劑,同時每孔20ul無血清培養基計算需用量,標記為D。
● 稀釋好的四組試劑常溫孵育5min。
● 將稀釋好的質粒DNA和miRNA mimics分別和對應轉染試劑混勻,常溫孵育20min。
● 將2。4步驟中試劑對應加入孔中。
● 轉染6h後,換新鮮完全培養基。
2、雙報告基因檢測
(1)質粒共轉染36-48h後,棄去培養基,用100μL 1XPBS清洗細胞。
(2)傾斜12孔板,吸乾剩餘的PBS。
(3)去離子水將5XPLB(裂解液)稀釋成1XPLB(現配現用),使用前放到常溫。
(4)每孔加50μL稀釋好的 1X PLB,置搖床振搖20-30min以保證裂解緩衝液完全裂解細胞。
(5)選用白色不透光的96孔酶標板中每孔加步驟4的上清液10μL, 加入100μL預先混好的Luciferase Assay Reagent II,2s後測資料,檢測熒光素酶反應強度。注意此步需在避光條件下進行。
(6)測定結束後,每孔新增100μL預先混好的Stop&Glo Reagent,靜止2s後,測資料,檢測內參海腎熒光素酶反應強度。
(7)記錄讀數:每個樣品會有3個數值:RLU1—螢火蟲熒光素酶反應強度, RLU2—內參海腎熒光素酶反應強度,計算兩組資料比值,即RLU1/RLU2。
(8)分析資料:比較1、2組可以發現由於對照組未轉染質粒,因此檢測不到熒光素酶反應強度。比較3、4組,由於轉染microRNA mimics進行microRNA的過表達,螢光素酶的活性降低,提示microRNA可能參與抑制靶基因的表達,需要結合定點突變等方法進一步確定miRNA與靶基因3’UTR的作用位點。
想要了解更多請關注:醫學實驗彩雲老師13576988994 QQ同微信1526328080