怎麼設計引物
作者:由 王厥 發表于 書法時間:2017-11-07
來一波狗糧!
怎麼來設計
引物
呢?
?今天我終於會了點皮毛,為了記住也方便一些和我一樣的科研?,不廢話,學起來!
就拿我要要設計的基因為例子,PPIB ,
現在NCBI上選擇gene,然後輸入目的基因,直接上圖!
找到這個基因的ID號,然後直接在百度上搜索primerbank這個網站,上圖!
點選進去,
在主頁,我們就可以看到幾個引數,我呢把它改成NCBI gene ID/ human /5479(這為基因的ID號)不過這些完全根據自己的實際情況來選擇。點選sumit。OK,上圖!
這就得到了我們的引物,不過呢,我們還要去驗證下哈,可以在NCBI或者UCSC上面blast一下!lets ?!
現在NCBI上面驗證
點選BLAST
在彈出的頁面上找到
primer-blast
點選進去哈
在primer parameters裡面輸入之前在primerbank 得到的引物的正反鏈,?!
好吧,這個我也不是很懂,那麼,我再用UCSC來驗證一下
百度上搜索UCSC,點選進去主頁
下拉tools點選In-silico PCR
一樣的方法,改好引數輸入正反引物,提交!
點選最上面的連結,別問我為什麼!
哈哈,這個可以看到設計的引物還是比較好的,因為也包括
內含子
了。。。。棒棒噠!
科研狗繼續學習去啦