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【Western-Blotting】蛋白提取與蛋白定量

作者:由 Doctor Zero 發表于 文化時間:2020-03-31

在《WB樣品準備》中筆者提到了WB樣本(細胞或組織)、蛋白變性及蛋白儲存的相關要點。在此,筆者簡要介紹蛋白的提取與蛋白定量。

一、蛋白提取

1、蛋白裂解液與裂解環境

現如今,商業化的蛋白裂解有很多中,有強效的、裂解時間短(約5-10min);也有普通的、裂解時間尚可(約30min);也有超強效的,裂解時間極短(小於5min)。其中,上述裂解液的裂解環境,一般推薦為冰上或者4℃裂解,減少蛋白降解;而在蛋白裂解液中也推薦加用磷酸酶抑制劑和蛋白酶抑制劑,抑制細胞內酶對蛋白的自然降解。

對於普通蛋白的提取,如實驗時間無特殊,選用普通的蛋白裂解液、冰上裂解即可;對於極易受環境影響的蛋白(比如低氧相關蛋白,HIF-1等),研究報道將細胞從低氧培養箱中取出2-3min即可影響HIF-1表達,因此宜選用超強效蛋白裂解液,並在低氧培養箱(37℃)中快速裂解。

2、組織蛋白提取

在組織蛋白提取過程中,一般推薦加用蛋白裂解液(磷酸酶和蛋白酶抑制劑)後,冰上研磨、勻漿化處理組織。組織來源不同,蛋白的產出亦不相同。歡迎各位留言,分享經驗,比如1mg組織能產出多少蛋白。

二、蛋白定量

1、蛋白濃度測定

蛋白定量的方法有很多種,應用較多的主要有兩種:BCA蛋白定量檢測法和Bradford蛋白定量檢測法,市售的蛋白定量試劑盒也多基於上述兩種檢測方法而開發的。兩種方法均需配製蛋白標準品,蛋白與定量試劑經過一定時間的反應(BCA法反應為37℃、20-30min,Bradford法反應一般為37℃,5min),酶標儀讀取樣品的OD值,繪製的蛋白標準曲線,依據標準曲線計算WB蛋白的濃度。兩種檢測方法筆者均有使用經驗,相比BCA法,Bradford法不僅節省反應時間,也無需配置反應試劑,簡單、快速、好用,筆者推薦Bradford法測定蛋白濃度。

嚴格來說,每次的蛋白濃度測定均需配製新鮮蛋白標準品,保證每次測到的蛋白濃度的準確性。然而,WB法評估蛋白表達水平本身就是一種半定量或者相對定量,因此在實際蛋白樣本準本及濃度測定時只需保證均一性即可,即使用同樣的標準曲線計算同一批蛋白的濃度,如果計算準備即可保證蛋白上樣時內參水平基本一致。因此,在實際操作中我們只需測定一次標準品的OD值、繪製標準曲線,即可用此曲線來計算後續實驗蛋白的濃度,節省時間和試劑。

具體的蛋白定量步驟,各位朋友參考試劑盒提供的方法即可,簡單易行。至於標準曲線的繪製,網路亦可查到不是帖子介紹用不同軟體繪製標準曲線,筆者在此不做詳細介紹,。如有需要,可本帖留言。

2、蛋白濃度的調平

有研究者喜歡計算新增loading buffer及變性以後的蛋白終濃度和上樣體積,然後在蛋白上樣時用loading buffer配平,保證上樣體積基本一致。而筆者更喜歡用loading buffer和蛋白裂解液調整蛋白濃度到基本一致(一般為1-2ug/ul)以後再變性,如此蛋白上樣時只需使用相同體積的蛋白樣品即可,筆者經驗是這樣的方法相對省時且不容易出錯。

標簽: 蛋白  裂解  濃度  定量  上樣