您當前的位置:首頁 > 體育

乾貨系列——ITC操作手冊

作者:由 萬建 發表于 體育時間:2018-07-05

乾貨系列——ITC操作手冊

應用範圍

蛋白質-蛋白質相互作用(包括抗原-抗體相互作用和分子伴侶-底物相互作用);蛋白質摺疊/去摺疊;蛋白質-小分子相互作用以及酶-抑制劑相互作用;酶促反應動力學;藥物-DNA/RNA相互作用;RNA摺疊;蛋白質-核酸相互作用;核酸-小分子相互作用;核酸-核酸相互作用;生物分子-細胞相互作用;

實驗時間較短(典型的ITC實驗只需30-60分鐘,並加上幾分鐘的響應時間),操作簡單(整個實驗由計算機控制,使用者只需輸入實驗的引數,如溫度、注射次數、注射量等,計算機就可以完成整個實驗,再由Origin軟體分析ITC得到的資料)。

測量時不需要製成透明清澈的溶液,而且量熱實驗完畢的樣品未遭破壞,還可以進行後續生化分析。

操作步驟簡單,總結起來就是上樣前洗滌反應池以及上樣針、設定程式開始反應以及資料收集、上樣後洗滌反應池以及上樣針、資料處理

乾貨系列——ITC操作手冊

洗滌

1。取出清洗聯結器,將其插入到反應池中,上端與廢液瓶(錐形瓶)相連,廢液瓶與泵相連。將洗瓶中加滿水,聯結器一端放入洗瓶中。

乾貨系列——ITC操作手冊

乾貨系列——ITC操作手冊

2。開啟泵,將蛋白與配體及其相應buffer放入真空室中,蓋上蓋子。點選左下角介面,點選On為抽真空,點選clean為清洗。

乾貨系列——ITC操作手冊

乾貨系列——ITC操作手冊

乾貨系列——ITC操作手冊

3。取出上樣針(針與針管分別放在存放盒中,拿出擰上即可)與滴定針,用水吸打至少50次。

乾貨系列——ITC操作手冊

乾貨系列——ITC操作手冊

乾貨系列——ITC操作手冊

4。清洗1-2個錐形瓶體積(約900ml),點選clean,將連線在泵後的廢液瓶管口拔出,再將廢液瓶中廢液倒出。

二、上樣及引數設定

1。用上樣針將反應池中多餘廢液吸出,用buffer潤洗上樣針1-3次,再吸取buffer潤洗反應池1-3次,全部吸出。

2。用上樣針吸取300ul(體積可調整,最多500ul)蛋白至反應池中(吸取時注意不要有氣泡)。

乾貨系列——ITC操作手冊

3。 用去離子水潤洗上樣針3-5次,潤洗後的上樣針吸取去離子水加入到參比池內,使水剛好溢位參比池口。

乾貨系列——ITC操作手冊

3。將黑色手柄垂直插入反應池上方,擰緊(有卡槽,放入時需將帶刻度一面偏右,邊向下插入邊向左擰緊至卡槽剛好卡住)。

乾貨系列——ITC操作手冊

4。開啟電腦及NANO ITC儀(也可一開始開啟),點選電腦桌面上LunchITCRun,彈出介面點選確定直至引數設定介面。(注意:在引數設定介面時,黑色手柄中刻度尺會開始校準,需要一定時間)

乾貨系列——ITC操作手冊

乾貨系列——ITC操作手冊

5.設定引數,一般為預設值(溫度:25℃,滴數:25滴,滴定間隔:120s),可根據實驗情況做調整。

6。引數設定左下角需填寫滴定針中樣品濃度與反應池中樣品濃度。

乾貨系列——ITC操作手冊

7。待右上角三角形變綠(即黑色手柄刻度尺校準完成)後,將黑色手柄取出。

8。滴定針用buffer潤洗1-3次,再吸取樣品50ul(注意不要有氣泡),將滴定針放進黑色手柄內,擰緊。再將帶有滴定針的黑色手柄插入反應池上方,擰至卡槽卡住。

9.點選藍色三角形按鈕,再點選綠色三角形按鈕,即可運轉。

10。開始後彈出頁面為儲存路徑與填寫檔名。

11。將上樣針用水洗10次左右,針與針管分離,分別放入存放盒中。

三、結束後清洗

1。待反應結束後,將黑色手柄取出(注意慢慢垂直取出,不要讓滴定針碰撞反應池,以免滴定針歪)。

2。將上樣針取出安裝好,吸出反應池中液體,按清洗步驟清洗。

3。用上樣針將反應池中殘留液體吸出。

4。清洗完成後,將滴定針與上樣針分別放入存放盒放好,黑色手柄插入反應池上方。

5。關閉泵,NANO ITC儀。

6。在儲存路徑中找出檔案利用Lunch NanoAnalyze進行資料分析。

7。關閉電腦,清理桌面。

乾貨系列——ITC操作手冊

操作注意事項

一、操作相關

1。上樣針針頭較長較細,清洗及上樣時需注意儘量不要抵住較硬物體,以免弄斷。

2。清洗聯結器連線好後,若沒有壓水至廢液瓶中,請檢查各部件是否密閉連線。

3。廢液瓶中廢液不得太多,以免被壓至泵中,對泵造成損害。

4。在清洗之前應準備好樣品,放入真空室中抽真空排氣泡,可邊清洗邊抽真空。先點選On,再點選clean。

5。各部件不用時需放入存放盒中,避免損壞。

6。黑色手柄帶滴定針插入反應池上方時一定要垂直放入,拔出時也要慢慢垂直拔出!

二、實驗相關

1。蛋白與配體buffer環境保持一致,如(1)存在DTT會干擾其真實的反應吸/放熱量(2)蛋白與配體PH不一致時,酸鹼滴定放熱量會干擾蛋白本身的反應吸/放熱量

2。蛋白與配體使用摩爾濃度

3。反應池中一般放300ul樣品,滴定針中一般放50ul樣品,當滴定資料不好時,可適當調整蛋白與配體的摩爾濃度

4。參比池一般放入300ul水,不用重新吸出,不要放入其他溶液

5。當ITC滴定圖雜亂時,可能是反應池未清洗乾淨,可適當用洗滌劑清洗,2ml洗滌劑加水至200ml,後多用水清洗

6。溫度、滴數、滴定時間間隔,滴定針轉速等一般為預設值,儘量不要自行調整,若實驗需要可適當調節。

乾貨系列——ITC操作手冊

標簽: 上樣  滴定  反應  清洗  廢液