VASP5.4.1及+VTST編譯安裝
VASP採用平面波贗勢（或綴加投影波）方法進行從頭計算分子動力學模擬的軟體包。官網：https：//www。vasp。at
VTST是VASP的過渡態工具，下載地址：
http：//
theory。cm。utexas。edu/vt
sttools/index。html
VASP及VTST安裝均無需root許可權，普通使用者在自己的目錄下也可以安裝使用。
VASP.5.4.1編譯安裝：
1。解壓縮VASP原始碼包：tar xvf vasp。5。4。1。tar。bz2 ，解壓縮後的目錄為vasp。5。4。1。
2。進入vasp。5。4。1目錄：cd vasp。5。4。1
3。檢視vasp。5。4。1目錄下有何內容：ls -l
檢視說明：more README
注：
vasp。X。X。X：解壓縮後的根目錄
arch：針對不同架構的Makefile模板，如裡面含有makefile。include。linux_intel
bin：編譯後的可執行程式檔案
build：編譯時自動複製src目錄內原始碼後執行編譯的目錄
src：原始碼目錄
lib：庫目錄，對應以前的vasp。lib目錄
CUDA：GPU CUDA程式碼目錄
4。檢視所用的編譯器：which ifort
如顯示不存在，那麼可以類似下面設定下Intel編譯器環境（具體路徑與你所使用的系統有關）：
。 /opt/intel/composer_xe_2015。1。133/bin/compilervars。sh intel64
5。檢視Intel MKL環境：echo $MKLROOT
如顯示不存在，那麼可以類似下面設定下Intel MKL環境（最好與編譯器版本一致）：
。 /opt/intel/composer_xe_2015。1。133/mkl/bin/mklvars。sh intel64
6。檢視Intel MPI環境（最好與編譯器版本一致）：which mpiifort
如顯示不存在，那麼可以類似下面設定下Intel MPI環境：
。 /opt/intel/impi/5。0。2。044/bin64/mpivars。sh intel64
檢視是否存在/opt/intel/composer_xe_2015。1。133/mkl/interfaces/fftw3xf/libfftw3xf_intel。a，如沒存在，那麼可以在自己目錄下編譯生成libfftw3xf_intel。a：mkdir -p ~/local/interfaces
cp -a /opt/intel/composer_xe_2015。1。133/mkl/interfaces/fftw3xf ~/local/interfaces
cd ~/local/interfaces/fftw3xf
make libintel64
順利的話，將在此目錄下生成libfftw3xf_intel。a。
7。採用arch/makefile。include。linux_intel做為模板（在vasp。5。4。1目錄下，未考慮CUDA）：
cp arch/makefile。include。linux_intel makefile。include
8。修改makefile。include：
必要時修改OBJECTS那，將
$（MKLROOT）/interfaces/fftw3xf/libfftw3xf_intel。a
修改為（假如使用~/local/interfaces/fftw3xf）：
其它引數，請見VASP官方說明。
9。為防止以前編譯好的。o和。a檔案與新修改的編譯配置衝突，建議清除以前編譯檔案：
make veryclean
10。執行編譯，可以預設編譯或分開編譯：
預設編譯（將編譯生成std、gam和ncl版）：make
分開編譯：
編譯標準std版：make std
編譯gamma-only版：make gam
編譯non-collinear版：make ncl
編譯完成後將在bin目錄下生成對應的版本的可執行程式：vasp_gam、vasp_ncl、vasp_std。
如果有錯，請注意看錯誤資訊，然後根據資訊進行處理。
VASP.5.4.1+VTST編譯安裝：
步驟基本和 VASP編譯安裝步驟一致。
在上述第3步和第4步之間加入如下操作：
設定VTST：
wget
http：//
theory。cm。utexas。edu/co
de/vtstcode。tgz
tar xvf vtstcode。tgz
下載：解壓縮：之後會生成vtstcode-171目錄，此目錄內包含以下檔案： bbm。F bdr_changes bfgs。F cg。F chain。F dimer。F dynamic。F dynmat。F fire。F instanton。F lanczos。F lbfgs。F mkbdrpro。pl neb。F opt。F qm。F sd。F vasp-5。3。2-main。patch vasp-5。3。2-mpmd。patch vasp-5。4。1-mpmd。patch
根據官方安裝說明
http：//
theory。cm。utexas。edu/vt
sttools/installation。html
：
需要將這些檔案複製到src目錄中：
因為src目錄下存在chain。F，建議先備份chain。F（可選）：cp src/chain。F src/chain。F-org
將vtstcode-171目錄下檔案複製到src下：cp vtstcode-171/* src/
修改src/main。F原始碼：
將（第3233行）
CALL CHAIN_FORCE（T_INFO%NIONS，DYN%POSION，TOTEN，TIFOR， & LATT_CUR%A，LATT_CUR%B，IO%IU6）
變為（注意後兩行）：
CALL CHAIN_FORCE（T_INFO%NIONS，DYN%POSION，TOTEN，TIFOR， & TSIF，LATT_CUR%A，LATT_CUR%B，IO%IU6） ！ LATT_CUR%A，LATT_CUR%B，IO%IU6）
修改編譯配置src/。objects，在chain。o前（大概第67行）新增如下內容： bfgs。o dynmat。o instanton。o lbfgs。o sd。o cg。o dimer。o bbm。o fire。o lanczos。o neb。o qm。o opt。o
注意後不能有空格。
如果有錯，請注意看錯誤資訊，然後根據資訊進行處理。
