好東西丨零基礎入門TCGA

課程大綱：

TCGA簡介

1、帶你熟悉新版TCGA介面

2、TCGA包含哪些資料，哪些是公開可用的？作為新手，下載什麼水平的資料最易上手

3、TCGA檔案ID介紹，讓你不在懵圈

例項演示TCGA資料下載、整合

1、單個癌症特定型別資料下載（基因表達資料），可直接下載或藉助下載工具GDC Data Transfer Tool

2、R處理資料的基本操作——資料整合、ID對應

TCGA簡單應用——某種癌症的差異基因篩選

1、應用R進行差異表達基因篩選流程

2、使用R軟體包進行差異表達基因統計分析、火山圖和聚類圖製作

附錄：

課件、程式碼及資料下載：TCGA入門

連結：

https：//

pan。baidu。com/s/1WYIUGm

WA5kdxVhk2BEqISA

密碼： ysi9