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Nat Chem Biol | 假尿苷合酶在miRNA加工和tRNA修飾中的新功能

作者:由 BioArt生物藝術 發表于 繪畫時間:2019-12-10

責編 | 兮

假尿苷修飾

(Pseudouridine,Y)是RNA上最豐富的修飾,又被稱為RNA的“第五種核苷”。假尿苷修飾是尿苷的旋轉異構體,它是由

假尿苷合酶

(Pseudouridine Synthases,

PUSs

)催化產生的。在tRNA、rRNA、snRNA等細胞內高丰度的非編碼RNA上均發現有豐富的假尿苷修飾;近年來,伊成器實驗室和其他課題組分別獨立開發了假尿苷修飾測序技術,發現mRNA和lncRNA上也存在豐富的假尿苷修飾

【1-4】

然而,目前對Y和假尿苷合酶的功能和機制知之甚少。2019年12月9日,北京大學生命科學學院

伊成器

教授團隊、北京大學第三醫院生殖醫學中心

李默

教授團隊在

Nature Chemical Biology

雜誌上聯合發表了題為

Differential roles of human PUS10 in miRNA processing and tRNA pseudouridylation

的研究論文,

揭示了人源細胞假尿苷合酶PUS10的雙重功能:在細胞核內PUS10調控microRNA(miRNA)的加工過程,在細胞質內PUS10催化tRNA的假尿苷修飾。

Nat Chem Biol | 假尿苷合酶在miRNA加工和tRNA修飾中的新功能

為了研究假尿苷合酶的功能,該研究首先進行了共表達分析,發現人源的13個假尿苷合酶中只有PUS10與microprocessor(DGCR8-DROSHA複合物)有共表達,進而猜測PUS10可能參與了miRNA的加工過程。PUS10敲除之後,透過晶片、高通量測序、qRT-PCR、Northern blotting等研究手段證明,大量成熟的miRNA表達量下降,同時伴隨前體primary miRNA(pri-mRNA)的累積,說明PUS10能夠促進pri-miRNA的加工從而調節miRNA的表達量。令人意外的是,PUS10對miRNA的調節作用不依賴於其假尿苷合酶的催化活性。分子機制上,核內的PUS10直接結合pri-miRNA並招募microprocessor,從而促進miRNA的生成。

該發現表明,

傳統意義上的假尿苷合酶PUS10具有調控miRNA表達的非經典功能。

另一方面,研究者透過回補實驗、體外活性實驗證實hPUS10確實能夠催化tRNA上的假尿苷修飾,並且其催化活性對維持細胞的正常生長髮揮作用。該研究也開發了新的小RNA中Ψ修飾的測序技術,並鑑定了PUS10的完整tRNA底物圖譜。進一步發現,PUS10是在細胞質內修飾tRNA底物,具有細胞質特異的催化活性。

Nat Chem Biol | 假尿苷合酶在miRNA加工和tRNA修飾中的新功能

綜上,

假尿苷合酶PUS10在細胞核內調節miRNA加工,而在細胞質內修飾tRNA。該工作首次報道了假尿苷合酶在miRNA加工過程中的調節作用,豐富了假尿苷合酶的功能。原文連結:https://www.nature.com/articles/s41589-019-0420-5

製版人: 小嫻子

參考文獻

1。 Carlile, T。 M。 et al。 Pseudouridine profilingreveals regulated mRNA pseudouridylation in yeast and human cells。

Nature

515, 143–146(2014)。

2。 Lovejoy, A。 F。, Riordan, D。 P。 & Brown, P。 O。Transcriptome-wide mapping of pseudouridines: pseudouridine synthases modifyspecific mRNAs in S。 cerevisiae。

PLoS One

9, e110799 (2014)。

3。 Schwartz, S。 et al。 Transcriptome-wide mappingreveals widespread dynamic-regulated pseudouridylation of ncRNA and mRNA。

Cell

159, 148–162 (2014)。

4。 Li, X。 et al。 Chemical pulldown reveals dynamicpseudouridylation of the mammalian transcriptome。

Nat. Chem. Biol.

11, 592–597(2015)。

標簽: 假尿苷  PUS10  miRNA  合酶  修飾