Nat Chem Biol | 假尿苷合酶在miRNA加工和tRNA修飾中的新功能
責編 | 兮
假尿苷修飾
(Pseudouridine,Y)是RNA上最豐富的修飾,又被稱為RNA的“第五種核苷”。假尿苷修飾是尿苷的旋轉異構體,它是由
假尿苷合酶
(Pseudouridine Synthases,
PUSs
)催化產生的。在tRNA、rRNA、snRNA等細胞內高丰度的非編碼RNA上均發現有豐富的假尿苷修飾;近年來,伊成器實驗室和其他課題組分別獨立開發了假尿苷修飾測序技術,發現mRNA和lncRNA上也存在豐富的假尿苷修飾
【1-4】
。
然而,目前對Y和假尿苷合酶的功能和機制知之甚少。2019年12月9日,北京大學生命科學學院
伊成器
教授團隊、北京大學第三醫院生殖醫學中心
李默
教授團隊在
Nature Chemical Biology
雜誌上聯合發表了題為
Differential roles of human PUS10 in miRNA processing and tRNA pseudouridylation
的研究論文,
揭示了人源細胞假尿苷合酶PUS10的雙重功能:在細胞核內PUS10調控microRNA(miRNA)的加工過程,在細胞質內PUS10催化tRNA的假尿苷修飾。
為了研究假尿苷合酶的功能,該研究首先進行了共表達分析,發現人源的13個假尿苷合酶中只有PUS10與microprocessor(DGCR8-DROSHA複合物)有共表達,進而猜測PUS10可能參與了miRNA的加工過程。PUS10敲除之後,透過晶片、高通量測序、qRT-PCR、Northern blotting等研究手段證明,大量成熟的miRNA表達量下降,同時伴隨前體primary miRNA(pri-mRNA)的累積,說明PUS10能夠促進pri-miRNA的加工從而調節miRNA的表達量。令人意外的是,PUS10對miRNA的調節作用不依賴於其假尿苷合酶的催化活性。分子機制上,核內的PUS10直接結合pri-miRNA並招募microprocessor,從而促進miRNA的生成。
該發現表明,
傳統意義上的假尿苷合酶PUS10具有調控miRNA表達的非經典功能。
另一方面,研究者透過回補實驗、體外活性實驗證實hPUS10確實能夠催化tRNA上的假尿苷修飾,並且其催化活性對維持細胞的正常生長髮揮作用。該研究也開發了新的小RNA中Ψ修飾的測序技術,並鑑定了PUS10的完整tRNA底物圖譜。進一步發現,PUS10是在細胞質內修飾tRNA底物,具有細胞質特異的催化活性。
綜上,
假尿苷合酶PUS10在細胞核內調節miRNA加工,而在細胞質內修飾tRNA。該工作首次報道了假尿苷合酶在miRNA加工過程中的調節作用,豐富了假尿苷合酶的功能。原文連結:https://www.nature.com/articles/s41589-019-0420-5
製版人: 小嫻子
參考文獻
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