ANT1: 一夫當關,萬夫莫開!
按:老基因,新功能。發育調控的主開關基因,但感覺研究還不是很深入,還有很多故事可以挖!
擬南芥
AINTEGUMENTA
基因(
AtANT
)是一個
APETALA 2
(
AP2
) 轉錄因子家族基因,之前研究顯示該基因參與胚珠發育和花器官發育,具體來說參與器官原基起始,雌配子體形成以及器官的生長和極性建成。
近期,臺灣中央研究院生物多樣性研究中心,美國芝加哥大學的Wen-Hsiung Li(李文雄)院士團隊在PNAS發表題為“Maize
ANT1
modulates vascular development, chloroplast development, photosynthesis, and plant growth”的研究論文,
發現玉米中的ANT1可以透過調控下游重要基因直接參與細胞增殖,葉片生長,維管和維管束的發育,葉綠體發育以及光合作用等重要的發育和生理過程。
首先共表達分析發現,玉米的4個
ANT
同源基因(
ZmANT1-4
),僅有
ZmANT1
與一個C4植物花環結構( Kranz anatomy)形成的關鍵調控基因
SCARECROW1(ZmSCR1)
在玉米胚葉發育過程中共表達(圖1A)。DNA affinity purification and sequencing(DAP-seq) 和EMSA檢測發現,
ZmANT1可以結合到ZmSCR1啟動子區的特異區段,調控其表達
(圖1B-D)。
圖1 玉米ANT1與SCR1啟動子的結合檢測
RNA原位雜交分析顯示,
ANT1
在發育中的葉原基中表達(圖2)。
圖2 RNA原位雜交檢測ANT1表達
為了進一步驗證
ANT1
基因的功能,利用CRISPR-CAS9基因編輯技術,研究者在青狗尾草(Setaria viridis)中編輯了
ANT1
同源基因SvANT1(
青狗尾草由於基因組小、高效轉化、生育期短,且易於實驗室培養操作,已發展成為禾本科黍亞科和C4光合作用的模式植物
)(圖3)。
圖3 Svant1基因編輯檢測
仔細觀察兩個移碼突變的編輯株系Svant1-2和-3發現,
ANT1基因的缺失會使突變體生長變慢,葉片和穗狀花序變小小,產量降低
(圖4)。
圖3 Svant1突變體表型檢測
由於ANT1可以直接調控
SCR1
的表達,所以研究者還比較了突變體和野生型維管的形態,結果顯示
突變體中維管形態異常,葉脈不能正常形成
(圖5)。
圖5 5周的WT和SvANT1突變材料的葉片維管表型檢測
之後,透過表達分析發現,
大量差異表達基因參與光合作用和葉綠體發育
(圖6A-F),突變體中淨光合速率值(Pn)顯著低於野生型(圖6G)。進一步實驗證實,ANT1可以直接結合光合作用,葉綠體和植物發育關鍵調控基因的啟動子(如SvSCR1,SvGNC, SvAN3等,圖7),直接影響這些基因的表達。
圖6 DEG,功能富集分析及突變體中光合作用的降低檢測
圖7 ANT1調控模型
總的來說,結合本文及之前的研究,我們可以知道,
ANT1是一個主開關(master switch),調控著花器官建成,葉片維管發育,葉綠體形成,光合作用,植物生長,最終影響穀物的產量
。
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